如果直接使用粪便来基肥带来很大的弊端，所以必须要发酵后才可以使用，发酵粪便做有机肥方法很多种，可以直接堆肥发酵，也可以加入发酵剂来发酵，还可以做沼气发酵后使用，怎么样肠道操作简单省事呢，首先是堆肥发酵，这样产生的弊端就是，发酵时间长，而且恶臭，病菌杂菌繁多，会造成二次污染，发酵沼气做有机肥出来的是液态肥，不方便运输，加入生物发酵剂发酵后的粪便做有机肥可以完全发酵，方面运输的同时，也可以发酵所有干湿粪便，操作简单方便。
发酵发酵农家肥做有机肥的方法:
所需材料：发酵2吨为例，各类粪便两吨、秸秆200公斤、米糠、锯末屑、蘑菇渣、干泥土粉等按适当比例混合（或完全用粪便发酵），欣圣源生物肥发酵剂原液10公斤（本品为原种，一盒起包邮发货，送使用说明，里面有详细的菌种做成菌液的操作方法和注意事项）
操作步骤：
先要把秸秆镰碎2-3厘米段。把欣圣源生物肥发酵剂原液10公斤，加入500公斤左右水中稀释（加水多少根据猪粪的干湿程度灵活掌握）。然后把秸秆和粪便混合后泼洒稀释过的菌液，来回反动搅拌均匀，控制好含水量在50%左右，堆积发酵即可，一般发酵第三四天时候需翻扒一次，翻扒时候如发现有没发酵的猪粪可继续撒入欣圣源生物肥发酵剂原液助其发酵 ，一般发酵10-15天即可完成有机肥的腐熟，粪便完全腐熟发酵后上农作物就不会出现烧根黄叶现象。
这里需要注意是：发酵粪便做有机肥为有氧发酵，需要提前释放出热量，不能完全密封，量大时，不必覆盖 ，只需在上方铺撒2-5公分厚度秸秆即可。
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各类动物粪便人畜粪便直接施肥或者自然堆积后使用，容易滋生有害病菌，而且施肥后作物特别容易烧根、烧苗，造成不必要的损失。欣圣源生物肥发酵剂，可以通过堆肥发酵，把其中的有害病菌吞噬掉，释放粪便中多余的热量，经过发酵的粪便，施用后不会出现烧根烧苗、肥效高、疏松土壤，是绿色、安全的微生物肥料。