建有机肥厂首先要办有机肥料生产许可证（需要2个部门的批复的，一个是环保，一个是消防），目前国家生产有机肥的标准时NY。规定有机质>30%，NPK（氮磷钾）>4%，同时对重金属，虫卵的数量等都做的规定。一般的，需要通过质监局办理生产许可证的有： 复合肥 复混肥 （BB肥）惨混肥 有机无机复混肥料 需要办理生产许可证。
有机肥料生产不需要办理很多证件，只需要到省土肥站办理登记证，其次要检测产品。检测的产品一定要跟标准一样，合格的有机肥不用办理生产许可证，但是必须办理产品登记证，具体程序到你们当地的土肥站咨询，每个地方都有差异。 再一个生物有机肥需要搞肥料登记 登记说明：农业部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心，总体要求： 1、申请者应是经工商行政管理机关正式注册，具有独立法人资格的肥料生产者。 2、申请肥料登记应当按照登记类型填写申请表和提供相关资料，申请者所提供登记资料，应列出总目录，包括所有资料的标题、排列位置和页码。
根据《肥料登记管理办法》，肥料登记分四种类型：1、临时登记——经田间小区试验后，需要进行田间示范试验、试销的肥料产品，生产者应当申请临时登记。2、正式登记——在获得临时登记后，经田间示范试验、试销可以作为正式商品流通的肥料产品，生产者应当申请正式登记。