天然锰砂或石英砂均能有效的去除地下水中的铁、锰等对人体身体有害的物质，但是石英砂滤料吸附能力小，开始效果不好。（成熟期一般要2个月）锰砂吸附能力大，开始就能机械吸附，所以采用锰砂滤料除铁除锰效果更好。
锰砂滤料工作原理：
铁以Fe2+的状态曾于地下（井）水中，其水有异色异味，污染离子交换树脂而降低交换能力，长时间后生成铁垢，影响传热，能腐蚀设备。而锰砂中的MnO2与Fe2+发生氧化还原反应，使Fe2+变为Fe3+并生成 Fe(OH)3沉淀，从而利用锰砂过滤器的反冲洗功能达到去除净化的目的。用于地下水除铁和除锰的天然锰砂滤料，其锰的形态应以氧化锰为主。含锰量（以MnO2计，下同）大于35%的天然锰砂滤料，既可用于地下水除铁，又可用于地下水除锰；含锰量为20%～30%的天然锰砂滤料，只宜用于地下水除铁；含锰量小于20%的锰矿砂则不宜采用。