刚挤出来的牛奶稀饭繁殖很快，应该迅速进行冷却低温保存，以抑制微生物的繁殖，牛奶想要饮用，需要进行巴氏杀菌，巴氏杀菌的温度是85度左右，保持30分钟，牛奶的消毒必须严格掌握好温度和时间。不然，既达不到消毒的目的，还破坏了牛奶的营养成分。全套的牛奶加工设备牛奶过滤器、牛奶均质机、牛奶杀菌机、牛奶制冷机、牛奶灌装机等。
巴氏奶的保质期比较短，一般为7天左右。南方天气较热，尤其进入夏季，这对巴氏奶都是挑战，消费者在购买、保存和饮用巴氏奶时，一定要注意牛奶的保质。如果发现纸盒有“胀包”现象，牛奶已经变质，一定不能饮用。所以在选购时要特别注意保存条件，任何一个环节的疏漏都会导致细菌的重生和牛奶的变质。
巴氏杀菌的温度和持续时间是关系到牛奶质量和保存期的重要因素，必须准确，加热杀菌形式很多，一般牛奶高温短时巴氏杀菌的温度通常为75度，持续15-20s，或80-85度，10-15s,如果巴氏杀菌太强烈，那么该牛奶就有蒸煮和焦糊味，稀奶油也会产生结块或聚合。牛奶经杀菌后，虽然绝大部分微生物都已消灭，但是在以后各项操作中仍有被污染的可能，为了抑制牛奶中细菌的发育，延长保质期，仍需及时进行冷却，通常牛奶的冷却温度为4度。
巴氏奶它是以新鲜牛奶为原料，采用巴氏杀菌法加工而成的牛奶，特点是采用72－85℃左右的低温杀菌，在杀灭牛奶中有害菌群的同时完好地保存了营养物质和纯正口感。经过离心净乳、标准化、均质、杀菌和冷却，以液体状态灌状，直接供给消费者饮用的商品乳。一般在巴氏菌乳的生产过程中，冷却、离心净乳和巴氏杀菌是必须的阶段。巴氏杀菌的目的首先是杀死引起人类疾病的所有微生物，经巴氏杀菌的产品必须完全没有致病微生物。从杀死微生物的观点来看，牛乳的热处理强度越强越好。但是，强烈的热处理对牛乳外观、味道和营养价值会产生不良后果。如牛乳中的蛋白质在高温下将变性；强烈的加热使牛乳味道改变，首先是出现“蒸煮味”，然后是焦味。因此，时间和温度组合的选择必须考虑到微生物和产品质量两方面，以达到良好效果。