发酵床的厚度原则上是越厚越好，厚薄并不是值得吹牛的关键技术，也就是说：厚薄并不能说明是谁的核心技术，你也可以先用40厘米的垫料，使用益加益发酵床养猪菌种来做发酵床养猪，这是完全可以的，只是使用到所有垫料都已达到了吸附和分解能力的饱和状态后，继续再在上面补充垫料即可以了，换句话说：40厘米的垫料使用寿命只有1年不到，而80厘米的使用寿命达到4年左右是没有问题的。我们有客户曾经做过40cm厚，从效果来看夏天还可以，就是进入冬季就必须添加垫料，保温性能跟不上。因此但我们不建议大家用这么薄的垫料。
另外，最关键的是，厚薄不只仅与使用寿命有关，而且与使用效率有关，太薄的垫料，在北方冬天是很不好发酵的，除非室内温度已经很高了，要知道微生物发酵需要一定的环境温度和湿度，太薄的垫料层，既不保湿，也不保温，微生物也不能形成集结优势，微生物发酵方面，内行的人都知道，当只发酵一点垫料，往往发酵不成功，如果发酵500公斤以上的垫料时，简单操作就可以发酵成功，发酵的量越大，发酵越容易成功。所以发酵床养猪要求面积越大越好。面积越大，里面的环境越稳定。更有利于微生物的生长繁殖。
而我们也知道，发酵床养猪垫料中一个稳定的微生态平衡，是保持发酵床活性的基础，而太薄的发酵床养猪，并不能形成稳定的微生态平衡。好的发酵床养猪菌种，也需要一个最基本的有效的载体基础量（即一定的厚度，最基础的厚度）。
根据南北气候差异，建议北方发酵床养猪厚度80cm 以上 ，南方在夏季可以在60cm。但是冬季也要在80cm以上。