按照绿色食品标准，暂不受理蕨菜、方便面、火腿肠、叶菜类酱菜的申报。为了推动绿色食品事业的发展，1992年11月，经国家人事部批准成立中国绿色食品的发展中心，为绿色食品的具体管理部门。并先后在全国29个省市、自治区成立了绿色食品管理机构，开展绿色食品的质量检验和绿色食品标志使用的审核工作。在受理的几千个产品品种中，按照《绿色食品标志管理办法》的规定严格审定，到2000年底，全国有5大类1000多个产品获得了绿色食品标志使用权，使绿色食品开发数量迅速增加。根据《绿色食品标志管理办法》第六条的规定，申请在产品上使用绿色食品标志的程序是：
第一、申请人填写《绿色食品标志使用申请书》一式两份（含附报材料），报所在省（自治区、直辖市、计划单列市，下同）绿色食品管理部门；
第二、省绿色食品管理部门委托通过省级以上计量认证的环境保护监测机构，对该项产品或产品原料的产地进行环境评价。
第三、省绿色食品管理部门对申请材料进行初审，并将初审合格的材料报中国绿色食品发展中心；
第四、中国绿色食品发展中心会同权威的环境保护机构，对上述材料进行审核。合格的由中国绿色食品发展中心指定的食品监测机构对其申报产品进行抽样、并依据绿色食品质量和卫生标准进行检测，对不合格的，当年不再受理其申请；
第五、中国绿色食品发展中心对质量和卫生检测合格的产品进行综合审查（含实地核查），并与符合条件的申请人签订“绿色食品标志使用协议”，由农业部颁发绿色食品标志使用证书及编号，报国家工商行政管理局商标局备案，同时公告于众。对卫生检测不合格的产品，当年不再受理其申请。