不仅动植物的遗体能形成化石，而且表明它们曾经存在过的证据或踪迹也都能形成化石。痕迹化石能提供有关该生物特点的相当多的情况。很多壳、骨、叶以及生物的其它部分，都能以阳模和阴模的形式保存下来。如果一个贝壳在沉积物硬化成岩之前就被压入海底，它的外表特征就会留下压印（阴模）。如果阴模后来又被另外一种物质充填，就形成阳模。阳模能显示出贝壳本来的外部特征。外部阴模显示的是生物体硬部分的外部特征，内部阴模显示的是生物体坚硬部分的内部特征。
据悉，美国北卡罗来纳大学的古生物学者在南美洲哥伦比亚的一座煤炭矿坑中，发现了这种巨龟化石。据推测，这种巨龟是在恐龙灭绝500万年后出现的，生活在距今6000万年前的时代。
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虽然生物体的软组织的保存形成了一些有趣的和令人叹为观止的化石，但这种方式形成的化石是相对罕见的。古生物学家更经常地是研究保存在岩石中的化石。
古生物学者表示，这种巨龟体型庞大，大小如同一辆汽车一般。它的头骨就有一只足球大小，下颚骨相当有力，可能以软体动物、小型乌龟，甚至是鳄鱼为食。
大概动物柔软部分的化石得以保存的著名的例子是在阿拉斯加和西伯利亚。在这两个地区的冻原上发现的大量的冻结的多毛的猛犸遗体种绝灭的象。这些巨兽有的已被埋藏达25000年。当冻土融解，猛犸的遗体就暴露出来。也有些保存得很不好，当它们暴露出来时，其肉被狗吃了，其长牙被象牙商倒卖。猛犸象的毛皮在很多博物馆展览，有的把猛犸象的或肌肉放在中保存。
在鄯善县境内，有一处特别的“墓地”，这里埋葬了上千只侏罗纪时期的乌龟骨骼化石，且数量丰富保存完整，实属罕见。近日，以乌龟化石为主题的纪录片《乌龟的墓地》在电视台10套播出了。
这些生活在1.65亿年前的乌龟们到底是什么品种，为何会大量埋葬在一起，在它们死前发生了什么，它们和现在存活的乌龟有什么不同，当时的鄯善又是什么样的？昨日，记者通过电话联系到沈阳师范大学古生物研究所博士周长付，他是发现乌龟化石科考队的专家之一，他将为读者揭秘神秘的“乌龟墓地”。
生物的本来的柔软部分只有当它被埋在能够阻止其柔软部分分解的介质中时，才能得以保存。这种介质有冻土或冰，饱含油的土壤和琥珀。当生物在非常干燥的条件下变成木乃伊，也能保存它的身体上本来的柔软部分。这种情况一般只发生于干旱地区或沙漠地区，并且在遗体不被野兽吃。