生物变成化石的更有趣和不寻常的一种方式就是在琥珀中保存。古代的昆虫可被某些针叶树分泌出的粘树胶所捕获。当松脂硬结后并进一步变成琥珀，昆虫便留在其中。有些昆虫和蜘蛛被保存得非常好，甚至能在显微镜下研究它的细毛和肌肉组织。
生物的本来的柔软部分只有当它被埋在能够阻止其柔软部分分解的介质中时，才能得以保存。这种介质有冻土或冰，饱含油的土壤和琥珀。当生物在非常干燥的条件下变成木乃伊，也能保存它的身体上本来的柔软部分。这种情况一般只发生于干旱地区或沙漠地区，并且在遗体不被野兽吃。
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研究成果显示，这些乌龟骨骼化石和恐龙化石属同一时期，而乌龟是集群埋藏的，一个接着一个叠加在一起，乌龟壳的直径在20厘米到30厘米之间。
根据这份发表在英国《系统古生物学杂志》上的报告，2005年，来自北卡罗来纳大学等机构的古生物学家在哥伦比亚北部一个煤矿找到了这种龟的头部化石，长24厘米，并在附近再挖掘出一个长172厘米的龟壳化石。有鉴于发掘的地点，古生物学家将这种龟称作“煤龟”。
美国古生物学者在南美洲哥伦比亚的一座矿坑中发现了一种巨型乌龟化石。据推测，这种巨型乌龟生活在距今6000万年前，体型庞大，甚至可能以捕食鳄鱼为生。
虽然生物体的软组织的保存形成了一些有趣的和令人叹为观止的化石，但这种方式形成的化石是相对罕见的。古生物学家更经常地是研究保存在岩石中的化石。
“这是科考队在开展古生物考察时，以逛街扫街的方式发现的，当时大片的乌龟化石被风化而裸露出来。根据一平方米范围内乌龟化石的数量推测，至少有上千只乌龟化石，我们判断这些都是淡水龟。”周长付说。