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发酵可以转化鸡粪中的非蛋白氮，转化率可达到非蛋白氮的30%，鸡粪中非蛋白氮可能有10%左右，可以将其中的3%转化成真蛋白；这种转化是需要付出代价的，物质从无序转化成有序的物质，是需要消耗大量的能量的，所以，我们常常说的把无机氮转化成菌体蛋白，的条件就是在液体发酵罐中，灭菌接种后，不断充入无菌空气（供氧），不断搅拌，进行充分的好氧发酵，才能大限度地转化成菌体蛋白，代价就是基本上消耗掉培养基中的能量；所以，这也就是为什么说，发酵鸡粪要求物料疏松的原因，因为发酵鸡粪是需要一定的好氧发酵过程的，才能充分的发酵好鸡粪，疏松的物料间隙中就含有适量的空气或氧气，有利于转化非蛋白氮，当然，也消耗了一些能量，
发酵鸡粪、秸秆饲料喂猪，为什发酵鸡粪不用加尿素，发酵秸秆需要
总之我们要知道，世界上没有一种技术是只获得好处，而没有代价的，越好的东西，往往价格也高，或使用费维护费用高等；要大限度地转化成菌体蛋白，就得大限度地付出能量的代价；
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尿素可以转化成菌体蛋白，但鸡粪中的非蛋白氮已经足够多了，没有必要再加尿素，再加的话，就太多了，也是转化不了的，除非象上文中说的那样，在液体发酵罐中灭菌接种，充气搅拌培养，但一般人没有这样的条件的。发酵秸秆中，可以在每吨秸秆中添加7公斤的尿素，这个加量是前辈们的经验，这里就可以加较多的尿素，因为秸秆中非蛋白氮极少，而且发酵秸秆中也有一定的好氧发酵过程，当然，即使是纯的厌氧发酵，也可以转化非蛋白氮，只是转化效率更低而已，这主要与发酵获得能量的方式有关，
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好氧发酵是在氧化磷酸化的水平上来获得转化所需要的能量，而氧化磷酸化水平上获得能量ATP的效率非常高，一个葡萄糖分子可以获得38个ATP，葡萄最终变成二氧化碳和水（而二氧化碳完全就是挥发到空气中，没有用的物质了），而厌氧发酵是在底物水平上来获得ATP，获得ATP的效率比较低，只能获得10个左右，当然，葡萄糖最终转化成乳酸，苹果酸，乙醇，柠檬酸，延胡索酸等中间代谢产物和香味物质，而这此个代谢产物仍然可以被动物所利用吸收再转化成动物所需要的能量ATP，所以，厌氧发酵是最不浪费的发酵方式，物尽其用，是最节省的模式，这也就是为什么发酵饲料发酵糟渣建议用厌氧发酵的方式的原因。