目前农村的厕所种类繁多，比较简陋，条件较差，孳生蚊蝇。粪便中的致病菌、寄生虫、肠道传染病菌随着液流入水中污染水源，传播给人类。而采用翁式化粪池进行厕所改造后，可有效防止因粪液泄露而造成的水源污染，控制蚊蝇孳生。
阻断人们传染于粪便有关疾病的传播途径，不仅减少疾病传播，而且美化环境，经处理后的粪液可做为无公害的肥料使用，也可自然排放，从而达到粪便无害化的目的。
双翁、三翁式（改良三格）卫生厕所的基本原理是利用寄生虫卵的比重大于粪尿混合液而产生沉淀作用及粪便密封厌氧发酵、液化、氨化、生物拮抗等原理除去和杀灭寄生虫卵及病菌，控制蚊蝇滋生