日本特许厅按类别区分（与中国相同，共同采用基于国际"尼斯协议"的"商品/服务国际区分表"），但就同一商标同时注册两个以上类别的，新增加的类别在注册文件费上可以享受优惠。
重要的是确定好商标注册类别，选择类别时，除了选择自己经营业务的类别之外，还可以选择一些相关类别，防止别人利用其它类别来侵犯自己的知识产权，当然，也有些人把所有类别全部注册，一般来讲，按国际标准划分，商标分为45个类别。
1． 申请条件
可以以自然人或法人申请，自然人必须附上护照或身份证复印件，法人必须附上营业执照复印件。
2． 商标申请所需材料
提交申请人的姓名、地址、国籍；
提供商标的中文或外文名称；
提供20份清晰商标图样；
如果商标为彩色，必须指定哪种颜色；如果提交的商标为黑白，以后使用什么颜色都可以；
所申请的商品或服务类别；
填写申请表1份，申请表必须由申请人签署或由代理人签署。
3.商标查询
由于商标的申请是一个复杂而漫长的过程，为了避免在申请的过程中出现徒劳无功并浪费金钱的现象，查询是一个必不可少的环节。查询通常可以得到两个结果，一是得知所申请的商标是否与他人的重复或类似；二是得知我们的商标是否符合日本关于商标法律的标准。法律并没有规定一定要通过查询的环节，但申请注册之前，先做好查册工作。
日本特许厅在受理申请时不提供免费查询，因此在注册之前建议进行独立的查询。