相对无公害、绿色食品而言，有机食品与其他产品的区别体现在如下几方面：1.有机产品在其生产加工过程中绝对禁止使用农药、化肥、激素等人工合成物质，并且不允许使用基因工程技术，而其他产品则允许有限使用这些技术，且不禁止基因工程技术的使用。如绿色产品对基因工程和辐射技术的使用就未作规定。2.在生产转型方面，从生产其他产品到有机产品需要2～3年的转换期，而生产其他产品（包括绿色产品和无公害产品）则没有转换期的要求。3.在数量控制方面，有机产品的认证要求有机食品的生产面积和产量确定。而其他产品没有如此严格的要求。
有机农业虽然不允许使用常规农业中使用的化学合成农药、肥料、生长调节剂和饲料添加剂、转基因技术等，但绝不是退回到刀耕火种的生产方式。有机农业仅排斥对生态系统和自然环境有不良影响的生产技术和物质，现代农业中设施栽培．微、滴灌技术、有害生物综合治理技术等仍提倡使用，以达到在保障食品安全和保护环境的同时还能提高产品品质与产量的目的。