自入2018年以来农业部进行新一轮的大整改不仅名称进行了修改而且随之而来的是系统内部的整改以及肥料企业上报肥料登记证步骤和大体流程进行了整改和修订，具体修订内容如下
一、（1）企业可自行开展农田作物进行肥料的田间试验（此项费用较多周期较长，一旦发生偏差企业损失严重）企业可自行委托山东潍坊德丰壹佰信息科技有限公司此公司多年来从事肥料企业的肥料登记证上报服务拥有多年的经验开展工作所涉及的肥料小区实验报告价低质高周期短@脱经理
（2）企业不可自行委托第三方检测单位进行肥料的检测，如自行检测按步骤进行提交农业部一律不认可，此项工作由农业部统一开展。（详情垂询@ 脱经理）
（3）自2018年起农业部统一取消临字登记，新证都将是五年准字证，（2015.、2016、2017等年度肥料登记证件续直接变更为准字证件）
二、（2）登记范围及管理机构：
1、农业部肥料登记。大量、中量、多种微量元素叶面肥、含腐殖酸、含氨基酸等水溶肥证件、有机水溶肥等 微生物肥料（20287微生物菌剂、884生物有机肥、T798复合微生物）必须到农业部办理有关登记手续，由农业部负责登记审批、登记证发放和公告工作。
2、省农业厅肥料登记。省农业厅负责复混、配方肥（不含叶面肥）、精制有机肥、床土调酸剂的登记审批、登记证发放和公告工作。