1. 选用无病土壤育苗：培育无病苗是丰产的基础。苗床是根结线虫传播的重要途径之一。选用没有种植过蔬菜的新土，施用充分腐熟的有机肥作底肥，注意种苗消毒，要挑选健壮且无病苗定植，这些操作可起到较好的预防作用。国内部分地区已采用无土育苗。苗床可使用线必治进行冲施来对根线虫进行预防。苗床禁用灭线磷、硫线磷、涕灭威等高度、剧毒产品，此类药剂接触瓜菜幼苗根部易出现烧苗。
2. 选用抗病、耐病品种，但部分抗病、耐病品种因其种子价格高、产量低等多方面原因推广面积一直不大。
3. 完全清除棚室病根残体：在前茬收获后及时清除病株、病根残体，注意将病根晒干集中烧毁。
4. 深翻土壤：将表土翻至40cm以下的深度，减轻病害的发生。
5. 轮作：重发病田可与抗线虫蔬菜如葱、蒜、韭菜轮作，他们对黄瓜线虫有较强的抗性，种植这些作物，可有效的预防或减轻线虫病的发生，降低土壤中的线虫量，从而减轻对后茬植物的危害。
6. 利用高温杀灭线虫：棚室可在休闲季节利用夏季高温，在盛夏挖沟起垄，沟内灌满水，然后覆盖地膜，密闭棚室，使30cm内土层温度达到50℃，保持15-20天，在高温厌氧淹水的条件下杀死线虫。一般来讲，覆盖时间越长，土壤消毒的效果就越好。以20cm深土层温度达到40℃时间累积达到120小时，相当于30℃气温的晴天累积20天，就可达到理想的防治效果。
7、药剂防治：生长期线虫严重的可直接使用线必治稀释800倍液进行灌根，高效省成本，或者进行冲施、滴灌都可以。