玛瑙属于玉石类，古人讲养玉，一个“养”字就包含了许多的学问，针对玛瑙的保养大致可分以下几方面。
保养一：玛瑙制品要避免与硬物的碰撞。虽然玛瑙的硬度较大，但受到撞击也容易破碎，特别是镂空的作品更容易损坏，平常摆放、携带要稳固结实，或是收藏在质地柔软的盒内。
保养二：玛瑙制品尽可能避免油污和灰尘。日常如要有灰尘的话，要用柔软的毛刷清洁；若有油渍污垢等附着在表面，应以温淡的肥皂水刷洗，再用清水冲净。
保养三：玛瑙制品避免阳光直射或过冷过热，以避免热胀冷缩而损坏。
保养四：玛瑙制品尽量避免与香水、化学试剂等物品接触，避免腐蚀而影响其鲜艳度和光亮度。
保养五：玛瑙制品的擦拭要用柔软的白布，避免划伤，有助于保养和维持原有的品质。
保养六：玛瑙制品存放的空间要保持适当的湿度，特别是在比较干燥的冬季更应保持空气的湿润。如水胆玛瑙制作时玛瑙层做得越薄越好，水胆部分要亮出来，行话叫“亮胆”，以提高其观赏性，玛瑙虽然致密，但还是有一定的微粒空隙的，因为外壁变薄，水分天长日久也会变干。
保养七：玛瑙制品清洗：长时间佩戴或摆放的玛瑙表面产生油污或灰尘。灰尘要用柔软的毛刷清洁；油污应以温淡的肥皂水刷洗，再用清水冲净。
保养八：要注意避开热源，如阳光、炉灶等，因为玛瑙遇热会膨胀，分子体积增大影响玉质，持续接触高温，还会导致玛瑙发生爆裂。
保养九：玛瑙要保持适宜的湿度，尤其是水胆玛瑙在形成时期里面就存有天然水，如果当前周围环境很干燥，就会引起里面天然水分的蒸发，从而失去其收藏的艺术和经济价值。