建筑工程资质证书年检不合格，企业将会承受以下后果：
对于年检不合格企业，省、市州住房城乡建设主管部门应根据其违法情形依法作出责令停业整顿、降低资质等级、吊销资质证书的处罚，并及时作出处罚决定许可或向资质许可机关提出处罚建议，一年内不予批准企业的资质升级申请和增项申请。
建筑工程资质证书年检材料：
1.动态考核申请表 2.企业资质证书正副本、安全生产许可证副本及法人营业执照副本； 3.企业法定代表人、企业负责人、技术负责人的任职文件、身份证、职称证书； 4.注册建造师的身份证、注册资格证书；临时建造师的身份证、注册资格证书； 5.技术负责人职称证复印件及社保缴纳证明； 6.近两年完成主要工程业绩证明材料； 7.近一年上报的行业统计报表及由统计部门出具的已进入统计部门建筑企业名录库的证明。 8.近两年内的奖罚情况证明材料。