发酵烘干鸡粪做有机肥与传统农家肥不同，生物有机肥经过高温腐熟，不含有害病菌和虫卵，避免了农家肥易烧苗、气味臭、病虫害多等弊端。但是烘干鸡粪自然生物发酵有机肥过程缓慢而且不彻底，有机肥中残留的那些有害细菌并没有被杀死，这样施肥会造成作物大量病害，因此在发展生物发酵有机肥的时候需要微生物菌剂来发酵有机肥。
将烘干鸡粪呈长条状平铺在地上，按鸡粪重的35%浇水，每吨鸡粪撒生物肥发酵剂5公斤稀释液和草粉混合物。而后将堆肥翻倒两三遍，堆成高约1米、宽2米的长方形物料堆，并在堆顶打孔通气。然后用秸秆稻草将肥堆覆盖，烘干鸡粪做生物肥为有氧发酵，不必密封起来，堆沤4~6天后，堆温可升至50~65℃。翻动一次，有没有完全被分解的底肥可以添加菌剂来促进分解，一般20天左右鸡粪既可以发酵腐熟完成。
冬季发酵粪便做有机肥的操作要求
冬季昼夜温差大，粪便含水量高，发酵粪便不容易起温，甚至会造成发酵失败，直接导致经济损失。在冬天做有机肥时，有机肥发酵时水分过大极易导致结冰从而影响整个发酵的升温。而且对于露天发酵的场地，极容易受到下雨天影响。根据这一环境条件，采用干料与湿料混合的方法发酵，将前期制堆一段时间较干的粪料与刚运来的湿粪料混合来降低整体含水量。