1 叶斑病：为黄精的主要病害，由真菌中半知菌属芽枝霉引起。危害叶片，从叶尖开始出现不规则的黄褐色斑，逐渐向下蔓延，雨季更为严重，直至叶片枯黄。
防治措施：收获时清园，消灭病残体；发病前和发病初期喷施1∶1∶100波尔多液或50%退菌特可湿性粉剂1000倍液，每7～10天喷1次，连续数次。
2 蛴螬、地老虎：危害幼苗及根状茎。防治措施:使用粪肥要充分腐熟，尽量用高温堆肥；灯光诱杀成虫；用75%辛硫磷乳油按种子量0.1%拌种；田间发生期用毒饵诱杀。
3 棉铃虫：为鳞翅目夜蛾科害虫，幼虫危害蕾、花、果。防治方法：用黑光灯诱杀成虫。在幼虫盛发期用2.5%溴氰菊酯乳油2000倍液，或20%杀灭菊酯乳油2000倍液，或50%辛硫磷乳油1500倍液喷雾。也可以用日本追寄蝇、螟蛉悬茧姬蜂等天敌进行生物防治。
4 蚜虫：危害叶子及幼苗。
防治方法：用50%杀螟松乳油1000～2000倍液或乐果乳油1500～2000倍液喷雾防治。
定期喷洒益富源植物营养液，菌液中的光合细菌可以促进光合作用，植株生长健壮，抗病能力增强。其他有益微生物进入土壤，增加土壤通透性，有利于根系生长，土壤益生菌增加，可以抑制病菌杂菌，减少发病几率。