第一、编程界面的相贯图形显示方式，好的数控相贯线切割机编程软件，应能按给定相贯参数显示管件的三维结构外形、展开的相贯线断面二维曲线、能从任意角度观察相贯线断面的三维图像、有仿真切割的动画等等。有人误以为，将4联动软件直接用于3联动，只需不计另一摆动轴即可，这是错误的。
第二、 能实现相贯线情况的编程范围，不同数控相贯线切割机编程软件，所能完成的相贯情况的范围是不一样的，特别是对例如空间3重管、空间交叉桁架等难度大的相贯情况，很多编程软件都还不能实现。当用户有某种编程扩展需求时，往往不能得到较好的解决。 一般来说，数控相贯线切割机在联动轴数相同时，实现相贯线坡口的能力都是一样的。
第三、编程软件对轴数的适应性，联动轴数不同时，数控相贯线切割机编程软件的计算公式是不一样的，不能把4联动的软件，简朴地直接用于3联动。
第五、特殊情况下的编程数据处理能力，很多数控相贯线切割机编程软件，对特殊情况下的相贯，数据计算均存在错误。如当管件间实际夹角很小，数控相贯线切割机实际摆角受限制时的数据处理等。