粪便厌氧发酵是一个复杂的生物学过程;粪便中碳水化合物、脂肪及蛋白质等,在缺氧的条件及微生物的作用下,有机物可转化为甲烷。此方法可提前沼气，配合沼气工程做比较合适，相对投资也比较大。
在厌氧阶段发酵处理过程中,根据温度的差异可分为:常温厌氧发酵(即低温厌氧发酵);中温厌氧发酵,一般温度控制在36℃～38℃;高温厌氧发酵其温度一般控制在52℃～55℃。
粪便好氧处理法：利用好氧菌进行发酵的过程,称之为好氧发酵。好氧发酵的速度较厌氧发酵快得多,但它需要合适的发酵场地或者发酵槽。同时处理过程中需要大量氧气,这个过程需要配合专用的设备来进行。
处理初期，需要调节水分，一般需要加入辅料，比如干的秸秆、稻草、蘑菇渣、稻壳等物质，按照一定比例添加进去，配合相应微生物产品，进行发酵处理。
经过12-15天时间，处理完成做成符合国标的有机肥。
有机肥成套设备包括：半湿物料粉碎机，卧式搅拌机，造粒机，烘干机，冷却机，滚筒筛分机，包装设备，皮带输送机等。一般，小型新建厂以年产一万吨吨/小时）、二万吨吨/小时）、三万吨（4.5-6吨/小时），中型工厂在年产3-5万吨，大型工厂在年产5-10万吨，特大规模可年产10-20万吨。投资规模及产品方案设计需要根据原料资源特点，当地土壤条件，当地种植结构与主要作物品种，工厂场地条件，生产的自动化程度等条件制定有机肥生产线及相关配套设备的采购。
利润分析
1、鸡粪：以平均每只鸡每日产生100g鲜鸡粪计算的话，目前我国每天产生鸡粪上亿吨。据《全国农业可持续发展规划(2015—2030年)》，未来氮肥施用需50%以上来自有机肥。财政部拟于年期间，对每个有机肥示范项目补贴300万元。目前干鸡粪大约10-20元/袋（50斤），笼养蛋鸡鲜鸡粉大约4-10元/袋，1万只肉鸡大概的鸡粪收益为4500元左右。如果利用鸡粪生产有机肥，不计算设备折旧的话，每吨有机肥生产所需的辅料、电费、人工成本大约为500-800元，出售价格为多元不等，每吨可获利500元以上。
2、原料来源：以10万头猪养殖基地来核算的话，每天大约产生猪粪200吨。以国内A级奶源供应站1000头牛计算的话，一头600公斤重成年牛，一昼夜排粪量约30公斤，占日采食量的70%左右，一昼夜排尿量约22公斤，占饮水量的30%左右.秸秆：以河北地区为例，全省秸秆可收集量为5842万吨，资源化利用5656万吨，利用率达到95%以上。
河南程翔重工机械专业制造年产1-20万吨有机肥设备、复合肥生产线设备、有机无机复混肥设备；主要产品有自动配料机、翻堆机、粉碎机、混合搅拌机、造粒机、烘干机、冷却机、筛分机、全自动称量包装机等。
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