羊肚菌和其他食用菌一样, 刺激子实体长出的主要因素为:光照、温差、水分、营养物质等。
培养原种和栽培种时要在暗室培养, 原因就是光照能刺激菌丝产生纽结, 过早的形成生殖生长, 影响菌种的保存。在实际生产中, 适当散射光可以促进子实体形成, 但要避免阳光直射。
在早春时, 白天温度回升, 但晚上的温度仍和冬天差不多, 这样较大的温差, 恰好适合羊肚菌的子实体生成。且温度在4~16℃中变化时, 是羊肚菌最适合的生长温度。
水分的管理通常要求为“干干湿湿, 干湿交替”。水分较少时可以促进菌丝生长, 水分较多时则促进子实体生长。因此, 给羊肚菌浇水的要点就是勤喷、少喷, 保持土壤湿润即可，空气湿度远高于土壤。喷水时水中加入益富源菌菇生态宝，补充土壤益生菌，保持土壤通透，有利于子实体生长，预防水菇病，另外益生菌分泌的蛋白酶可以促进菌丝吸收营养袋养分，保证营养充足。
营养物质的刺激主要来自于外援营养袋, 在大田栽培的羊肚菌营养不如室内工厂化生产丰富, 添加外援营养袋即可满足大田生产的要求。
出菇时, 要保证覆土的土壤湿润, 土壤含水量为50%~60%, 浇水要勤, 但量不宜多, 以喷雾状水为宜。如果遭遇干旱, 更要保持土壤湿润, 否则严重影响产量。