在情绪活动中起整合作用。复杂和灵活的行为模式是在经验的基础上，加入情绪因素，后通过运动系统表达出来。边缘系统与皮质联合区之间存在密切的联系，颞、顶、枕叶联合区的信息通过边缘系统的扣带回传至额叶联合区。此外，与皮质下结构的功能亦密切相关。丘脑和下丘脑 丘脑为联络站，将所有感觉信息转运至皮质。丘脑与复杂的智能加工、情绪和记忆密切相关。下丘脑在维持内环境稳定上扮演重要角色，通过直接或间接途径调节控制内分泌，调节控制体温、摄食、情绪和相关行为。胼胝体 是联系左、右大脑半球的纤维，负责将左运动前皮质编制的运动计划和陈旭传递至右半球。胼胝体损伤后可出现单侧肢体的意念运动性失用。
（2）左、右大脑半球与认知功能的关系 大脑两半球以胼胝体相连，且结构大体相同。大脑处理感觉信息和运动信息的方式以及大脑外周感觉的传导，甚至运动器官通过大脑相联系的传导通路，基本上左右交叉、两侧对称。然而，大脑两半球存在着功能上的不对称性。美国心理学家Sperry与他的同事们从20世纪50年代开始就对人类大脑半球的不对称性做了大量的研究。他们发现大脑皮质的高级功能在两半球并非对称分布，而是有一定的专门化（见下表）。正常情况下，大脑两半球各自处理不同类型的信息，这种分工通过半球间的联络纤维传送信息来协调。从总体上看，左半球专管语词能力如语言、阅读、书写，也涉及数学能力和分析能力；右半球是非语词性的，它以形象而不是以语词进行思维，主管与空间合成或概念有关的能力如空间认知和旋律等。