决定苗木评估价值的因素较多，但在实际中主要考虑以下四种因素：
一是品种：不同品种决定不同价值。如红叶石楠，日本红叶石楠价值是普通红叶石楠的3倍以上；品种月季是普通月季价格的数倍；枫树中的红枫、鸡爪槭是青枫、枫香价格的数倍。名、特、优价值昂贵。常绿高于落叶，彩色植物高于一般绿色植物。珍稀濒危的“活化石”植物评估价值更高。
二是形体：高度、径级的大小、冠幅丰满程度、树木长势以及枝条生长情况和树木健康状况等都直接决定评估价值高低，如桂花树，杆丛生的其价值仅有独杆的一半；雪松冠幅大层次好的其价值大大高于冠幅层次一般的雪松。奇型植物，造型植物评估价值大大高于常规植物。
三是树龄：树龄越长，价值越大。如桂花树，树龄10年的仅值千元，50年的则万元以上；百年的可达十万。银杏树、紫薇树也是如此。古木、古树由于年限长，文化价值更高。
四是市场因素：物以稀为贵，市场供求关系对苗木、花卉价格评估有直接影响，在小规格苗木和新品种上尤为明显。如日本红叶石楠现在的价格仅是三年前价格的一半。雪松、广玉兰由于种植太多，现在的价格仅是三年前价格的三分之一。受一次性“建园林”的工程理念影响，大规格苗价值远远高于小规格苗。