番茄细菌性髓部坏死，一旦上病，传染很快，而且侵染到作物髓部，即使用药，必然造成损失，应抓住预防的关键时期，防患于未然。
1、综合防治：1.高温闷棚，减少多年连作积累的恶性菌；2.增施有机肥、生物菌剂（地力旺）、中微量元素，活化土壤中固定的多种元素，改善土壤团粒结构，增加土壤透气性，提高肥料利用率，促使根系发达，植株健壮。3.高垄栽培，减低湿度，提高地温，减少病害的发生。
2、尽量减少伤口。科学摘叶去枝，尽量是选在晴天进行，打老叶时，要适当留一段叶柄，整个区域农事操作后及时用青枯立克300倍进行喷雾，传导杀菌，补充营养，修复伤口，减少病菌侵染。
3、提前预防。定植前:使用青枯立克100-150倍+地力旺300-500倍+沃丰素600倍进行蘸根；缓苗期及苗期：使用青枯立克150-300倍+地力旺300-500倍+沃丰素600倍灌根1-2次，（也可同时喷雾）；花果期：使用青枯立克150-300倍+沃丰素600倍喷雾2-6次，（也可同时灌根）；病害高发期同时复配大蒜油倍或其它化学药。
4、控制方案：发现病情初期，使用细截或靓果安 150倍+青枯立克100-150倍+大蒜油倍+沃丰素600倍+有机硅进行喷雾+灌根，连用2-3次，间隔2-3天（喷雾需要1天喷1次，连续喷雾3天）；病情严重的复配其它化学药。