1、企业很少申报项目
对过程和项目申报书不熟悉。
2、对政策的解读不够深入
而购买的专利是符合条件了，但是没有跟产品连接在一起，财务报表上也无法体现出来，结果是表面上符合了政策的条件，事实上是很明显的充数，专家一看就知道该企业不合适。
3、高新项目资料收集不仔细
高新项目资料不只是一个一个条件拼凑这么简单的，四个板块是息息相关的，知识产权和审计有关，和财务有关，后面的RD、PS表都需要根据知识产权去编写。稍微不留意就很容易前后矛盾，一个小小错误就可以让专家的评分很低，导致无法通过。
4、公司产品不属于高科技能申报高企认定吗-
首先，这是一个误解。对于高新企业认定，一般企业了解不多，对政策了解不深才导致这样的误会。
《高新技术企业认定管理办法》的相关规定如下：产品必须是在《国家重点支持的高新技术领域》范围内。国家重点支持的8大高新技术领域为：电子信息技术、航空航天技术、高技术服务业、资源与环境技术、生物与新医药技术、新材料技术、新能源及节能技术、高新技术改造传统产业。
最后一项就是没有很高科技含量产品的企业所属的范围。高新技术企业有相当一部分是属于这个范围的，最典型的代表是某些山泉水、果冻等企业，从产品来看，不属于航空航天或者生物技术之类我们平常了解的高科技领域，不过他们符合高新技术企业认定管理办法的条件，他们就是高新技术企业，享受国家15%的企业所得税的税收优惠减免。换言之，只要符合申报高新技术企业条件，其实就可以是高新企业。
5、公司规模小可以申报高新技术企业认定吗-
目前的《高新技术企业认定管理办法》取消了之前的申报高新技术企业认证中的一些要求，例如要求年销售额在5000万以上、研究型企业要在1500万以上，国家是通过这个政策，鼓励重视科技研发知识产权的中小型企业申报，这个说明政策更加倾斜于中小型发展良好的企业。
不过新的规定要求，申报企业高新产品的产值，要占到销售总额的60%以上。这个要考虑到高新产品(跟知识产权相关的产品)占的比率。为什么要这样限制呢-因为有些企业是生产和贸易一起做的，也生产自己的产品，也做代理，销售收入就不一定是高新产品的收入了。
6、企业专利数量不够怎么申报高新技术企业-
高新技术企业认定规定申报企业必须拥有至少1个发明专利和6个实用新型专利，那么倘若企业想要申报高新技术企业，却在知识产权条件上达不到标准怎么办-高新认定规定明确说明，申报企业所拥有的知识产权资产，可以是自主研发，同样也可以是受让、受赠、并购等方式，这说明企业专利储备的渠道可以是多元的，政府鼓励企业通过专利的市场化配置提升企业的专利技术实力，也愿给予这些企业享受高新技术企业优惠政策。所以企业专利数量不够固然是申报高新的一大障碍，但也并非没有解决的办法，买专利就是企业在专利数量不够的情况下申报高新的最便捷、最有效的办法。
7、申报高新亲力亲为还是找服务机构-
有人会问，申报高新企业认定，是自己去走流程还是请服务机构代办更好-
其实，高新技术企业认定管理办法政策规定是非常严格的，其申报流程也是相当复杂，由此可见，假如是条件非常符合高新技术企业认定要求，你也熟悉申报流程和相关事宜的，自己申报也是好的。但是假如是企业自身很少申报政府的科技项目，对材料组织编写缺乏经验，又非常想要申请高新认定，在这种情况下，聘请专业有经验的服务机构中介机构代办，无疑是很好的选择。聘请服务机构整理资料，是经验和条件不足的企业不二的选择。