滇重楼属多年生草本植物，生长周期长，从播种到收获需8年至10年时间，近年来随着需求量的不断增加，采挖速度远远超过自然生长的速度，导致重楼资源已呈稀缺状态。在生产中采用人工育苗繁殖是解决这一状况的有效途径。滇重楼苗期病虫害管理是人工繁殖过程中的一个重要生产环节，因此在苗期应做好以下病虫害防治工作及田间管理措施
根腐病是真菌类疾病的一种, 重楼在种植的过程中, 无法对土壤资源进行细化处置, 这使得很大一部分病菌有可能在土壤当中滋生, 并且无法在冬季严寒气候中得到合理控制。在重楼根腐病细菌初步滋生的情况下, 3月下旬至4月上旬最有可能影响到重楼种植质量;进入5月之后, 重楼的疾病则进入盛发期。在气候条件不能得到合理控制的情况下, 温度和湿度都有可能成为根腐病发生的诱因。同时, 光照也可能对重楼种植质量形成较为直接的影响。
重楼根腐病的症状：重楼根腐病发病早期植株没有任何症状，后期随着根部腐烂程度的加剧，吸收水分和养分的功能逐渐减弱，地上部分因养分供不应求，在中午前后光照强、蒸发量大时，植株上部叶片会出现萎蔫，但夜间又能恢复。最后整个根茎腐烂，地上植株萎焉，逐渐枯死。发病原因主要是6-7月田间湿度大，积水，气温高及根茎有创伤，易遭受病原物感染所至
白芨重楼枸杞等中草药根腐病属于土传性病害。像这种土传病害，重点在于预防，防大于治。主要靠土壤传播，即土壤中带菌，多年重茬、土壤板结、酸化、盐碱地等，极易爆发土传病害。多年重茬土壤中病菌多，而且作物有自我排毒作用，都会将毒素排到土壤中，连年种植作物对某些元素吸收过多，土壤中营养严重缺乏。土传病害的防治根本在土壤，应从土壤入手。具体防治分四个步骤：
1、改土。多使用有机肥、生物菌肥、土壤改良剂-奥农乐、农家肥，农家肥要用腐熟的粪肥，未腐熟的有机肥除了易造成烧根外，还有很多虫卵、病原菌，腐熟不彻底会给土壤带进很多病菌，增加上病概率。有机肥能够促进土壤结构形成，改善土壤物理性质，改变土壤孔隙度，提高土壤蓄水能力，富含大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰富的营养元素。不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分。土壤调理剂-奥农乐由8种有益菌、中草药、海藻和矿物质组成，内含丰富营养，菌量大，活性高，能够提高土壤中有机质的利用率，增加土壤的透气性。
2、重治。对于已经上病的，要通过提高用药浓度、缩短用药间隔期、立体化用药、复配用药等方式重治。中草药制剂安全性高，可高浓度连续用药，一下将病害控制住且有累积作用，不但能杀菌治病同时还能为作物提供多种营养物质，起到复壮作物，增强其抗病抗逆能力的作用。方案：青枯立克100-150倍+地力旺300倍+沃丰素600倍灌根1次，叶面用青枯立克100-150倍+大蒜油倍喷雾，连续用药2-3次，每次间隔2-3天。