儿童抽动症的发病机制比较复杂，在前几年的研究中，发现一般检查对抽动症的诊断并无特异性，是一种没有具体的致病诱因的疾病，病因和发病机制迄今尚未明确，有可能是遗传因素所致，有可能是大脑内神经递质代谢失常所致等，但各种说法均比较狭义，缺乏可靠的数据支持，至今西医也没有对儿童抽动症的病因作出具体的解释。
虽然不能通过实验检查发现儿童抽动症的发病原因，但是我们能从患儿的发病过程中总结出一些诱发儿童抽动症的因素，其中呼吸系统感染、情绪过激、外伤、环境污染、饮食不合理等最为多见，除此之外还有遗传因素。并且，在临床上发现，这些因素不但是儿童抽动症的诱发因素，也是其病情加重的原因。另外，临床中发现，多数儿童抽动症患儿发病前都有呼吸系统感染史，这可能是诱发儿童抽动症最常见的因素。
抽动症探查病因最重要
抽动症的治疗一定要从发病原因治疗，以达到治疗的远期效果，如果治疗不注意抽动症的发病原因，一味的治疗表面症状，很容易导致停止治疗不多久就复发的常见现象。
另外治疗抽动症好是用物理疗法治疗--经颅磁刺激仪，中药治疗见效慢、口感差、无法长时间坚持，西药所用抗精神病药和抗药可能起到迅速的疗效，但是副作用大，且预后容易复发，远期效果不理想。
治愈儿童抽动症关键所在
抽动症怎么办-
——经颅磁刺激仪
它的原理主要是利用脉冲磁场作用于中枢神经(主要是大脑)在刺激部位产生感应电流，改变皮层神经细胞的膜电位，影响脑内代谢和神经电活动，从而引起一系列生理生化反应。
——rTMS经颅磁刺激克服了电流不能进入颅脑的缺陷
颅骨是不导电的生物体。采用传统的电刺激方法电流无法进入到颅内，电流就无法刺激到大脑。而电磁具备了与生物组织磁导率基本一致的特点、磁力线容易穿透颅骨到达脑内较深层组织，电磁作用在脑细胞上生成感应电流，在适当加大电流的情况下，电场可改变细胞自身的膜电位，促使细胞轴突发生变化，通过重复rTMS的刺激，对大脑神经元和相关功能进行调理。