一套完整的反渗透设备系统分别由预处理部分、反渗透主机（膜过滤部分）、后处理部分和系统清洗部分共同组成。
预处理部分：
反渗透设备的预处理常常由石英砂过滤装置、活性炭装置、精密过滤装置组成，主要目的是去除原水中含有的泥沙、铁锈、胶体物质、悬浮物，色素、异味、生化有机物，降低水中的余氨值及农药污染等有害的物质。如果原水中钙镁离子含量较高时，还需增加软水装置，主要目的在于保护后级的反渗透膜不受大颗粒物质的破坏，从而延长反渗透膜的使用寿命。
反渗透主机：
主要有增压泵、膜壳、反渗透膜、控制电路等组成，是整个水处理系统中的核心部分，产水水质的好坏最主要也取决该部分。只要膜的型号及增压泵的型号选取得当，反渗透主机对水中盐分的过滤能力都能达到99%以上，出水电导率可保证在10us/cm（25度）以内。
后处理部分：
主要是对反渗透主机制取的纯水作进一步的处理，如果后续工艺接离子交换或电去离子（EDI)设备，则可以制取工业用超纯水，如果用在民用直饮水工艺上，则常常接后置杀菌装置，例如可以接紫外线杀菌灯或者臭氧发生器，从而使出来的水可以直接引用。
清洗部分：
为了保证反渗透设备系统的正常运行及延长反渗透膜元件的使用寿命，当反渗透设备系统运行一段时间后为去除碳酸钙垢、水中金属氧化物垢、生物滋长（细菌、真菌、霉菌等）等物质就需要对系统进行清洗。
纯水设备安装步骤
1、将预处理器和反渗透纯水主机安置在接近水源和电源的地方。
2、填装石英砂、活性炭、软化树脂等过滤材料。
3、连接水路：分别将原水泵进水口与水源、预处理过滤器出口与主机进口连接，预处理过滤器、主机排水口均用管路连接至下水道。
4、电路：首先将接地线可靠接地，并将随机所配电源线接到房间电控箱内。
5、通入水源、电源，按照“预处理操作说明”的要求按步骤操作，预处理调试操作完成。
6、使用本机，原水泵开关，拨在自动位置，并旋开停机开关。接通水源、电源，待多级泵口压力达到压力控制器设定值时，多级泵启动工作。多级泵启动后，调系统压力在1.0-1.2Mpa。首次启动应对RO膜系统进行手动冲洗30分钟。