饮用水的主要杀菌方式有两种：一种是紫外线杀菌，另一种是臭氧消毒器杀菌。由于紫外线的杀菌强度较弱，无滞后杀菌作用，所以目前在该行业中使用紫外线杀菌方法的厂家正在逐渐减少。越来越多的厂家在了解到臭氧杀菌消毒的强悍效果之后，选择使用饮用水臭氧杀菌方法。
臭氧消毒器施放臭氧进行杀菌消毒的原理是：臭氧在水中发生氧化还原反应，产生氧化能力极强的单原子氧（O）和羟基（OH），瞬间分解水中的有机物质、细菌和微生物。羟基（OH）是强氧化剂、催化剂，可使有机物发生连锁反应、细菌和微生物。羟基（OH）对各种致病微生物有极强的杀灭作用。对顽强的微生物如病毒、芽孢等具有强大的杀伤力。
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