天珠的起源可追溯到公元前3000年至1500年之间，阿利安人的印度古国。当时的人们为求神佛庇佑，天珠此被创造出来。当时人们以古老文献中记载的咒术、图腾等符号图案造型(也就是现在天珠上的各种图案)，画于石材上，进于达到提升精神意识的效益。依经书记载:远古时因受地理环境及天然灾害的影响，求神助佑之心自然产生，"天珠"因而被创造出来。同时，渗进了各种药物治病，并用巫术咒语的图腾意念，符画于石材上，借以获得诸佛众神的加持与护佑。
天珠用于敬奉佛菩萨之事迹具代表性的记载为唐太宗贞观十五年(公元六四一年)文成公主下嫁吐蕃赞普松赞干布时，带了一尊从印度请来的佛像作为陪嫁，最后这尊佛像坐落大昭寺的释迦殿内，而这尊佛像即被镶上了百余颗各式各样的天珠，包括三颗九眼天珠，及三眼天珠、二眼天珠、宝瓶天珠(或称永生瓶天珠)、虎纹天珠和其它带眼天珠。目前这尊佛像安奉于大昭寺的释迦殿内。