巴氏杀菌法的产生来源于巴斯德解决啤酒酿出后变酸的努力。当时，法国酿酒业面临着一个令人头疼的问题，那就是啤酒在酿出后会变酸，根本无法饮用。而且这种变酸现象还时常发生。巴斯德受人邀请去研究这个问题。经过长时间的观察，他发现使啤酒变酸的罪魁祸首是乳酸杆菌。营养丰富的啤酒简直就是乳酸杆菌生长的天堂。采取简单的煮沸的方法是可以消灭乳酸杆菌的，但是，这样一来啤酒也就被煮坏了。巴斯德尝试使用不同的温度来消灭乳酸杆菌，而又不会破坏啤酒本身。最后，巴斯德的研究结果是：以50~60摄氏度的温度加热啤酒半小时，就可以消灭啤酒里的乳酸杆菌和芽孢，而不必煮沸。这一方法挽救了法国的酿酒业。这种杀菌法也就被称为“巴氏杀菌法”。
国际上通用的巴氏高温杀菌法主要有两种：
一种是将牛奶加热到62~65℃，保持30分钟。采用这一方法，可消灭牛奶中各种生长型致病菌，杀菌效率可达97.3%~99.9%，经杀菌后残留的只是部分嗜热菌及耐热性菌以及芽孢等，但这些细菌多数是乳酸菌，乳酸菌不但对人无害反而有益健康。
第二种方法将牛奶加热到75~90℃，保温15~16秒，其杀菌时间更短，工作效率更高。但杀菌的基本原则是，能将病原菌消灭即可，温度太高反而会有较多的营养损失。
巴氏杀菌机主体罐组成：水循环罐和奶罐，奶罐分为三层、外层是保温层，中间是热水杀菌层，里层是奶，牛奶巴氏杀菌机，鲜奶巴氏杀菌机的原理是在一定温度范围内，温度降低，细菌繁殖越慢温度越高，繁殖越快，但是温度太高，细菌就会死掉，不同的细菌有不同的适应生长温度和耐热，耐冷能力，牛奶巴氏杀菌机、鲜奶巴氏杀菌机其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部消灭，巴氏杀菌后，牛奶中任然保留了小部分无害或是有意、耐热的细菌或者是细菌芽孢，这有效的保留了牛奶的营养成分，是牛奶更加健康，口味更加纯正。