市场上巴氏杀菌机主要做商业用途，同时巴氏杀菌也是国际上的通用杀菌标准，在很多大型企业都在使用，市场上的纯牛奶其他口味的酸奶都是经过巴氏杀菌。随时绿色健康食品的发展，巴氏杀菌机在很多小型的奶牛场都是有使用的，小型奶牛场使用的都很是100升或者是200升的，主要是制作新鲜纯牛奶，向市场上配送。巴氏杀菌机配备有冷水循环系统，通常的制冷方式有两种，一种是：压缩机制冷，这种制冷的方式速度快，效果好，还一种制冷方式是冷水循环制冷，主要是采用物理的降温方式，将对来讲成本要低很多。
目前国际上通用的巴氏杀菌法主要有两种：一种是将牛奶加热到62-65℃，保持30分钟。这种方法目前在广东较少使用。采用这一方法，可消灭牛奶中各种生长型致病菌，杀菌效率可达经杀菌后残留的只是部分嗜热菌及耐热性菌以及芽孢等，但这些细菌占多数的是乳酸菌，乳酸菌不但对人无害反而有益健康。第二种方法将牛奶加热到75-90℃，保温15-16秒，其杀菌时间更短，工作效率更高。但杀菌的基本原则是，能将病原菌消灭即可，温度太高反而会有较多的营养损失。注意，巴氏杀菌法并不能消灭结核杆菌。
设备是专门为乳品饮料或类似液体物料设计的一次杀菌设备，是物料通过杀菌、冷却达至延长保质期目的的理想设备。可根据用户对不同物料的加热、杀菌、保温、冷却的不同工艺要求，进行不同的流程组合设计，满足工艺要求，具有各种安全保护措施和高温报警，低温回流之功能。同时，可根据用户要求，配置相应的高精度的自动控制系统。板式超高温杀菌设备适用于鲜奶、果汁饮料、酒类等热敏性液体的加热、杀菌、保温和冷却等工艺要求。