有些企业以公司制定的“事故为零”等目标为基准，对综合办公室、安全、财务、供应、采购、生产、车间等各部门的目标全部是重伤以上事故为零、火灾事故为零、职业病为零、轻伤控制在2‰以内。认为只有这样才能与公司的目标相对应，只要各部门目标实现，公司的目标就可以实现。科学、规范的安全系统管理应该是“全员、全方位、全过程和全天候”的安全管理，全员的安全管理，首先要求从总经理直到每一个操作工人都要制定各自的安全生产责任制，明确并履行各自的职业健康安全职责，在安全职责的基础上制定职业健康安全目标。各层次、部门目标制定后必须制定管理方案，以确保目标的实现。
综上所述，职业健康安全管理体系能否正常地运行，首先是体系文件是否按照标准编写，是否符合本企业的实际情况，充分考虑可行性、适用性和可操作性。在管理体系的建立和实施中，以下几个环节是保证体系正常运行的基本条件：充分辨识本企业的危险源并科学评价，确定重要危险源，对每一个危险源制定预控措施、企业针对重要危险源、安全生产存在的主要问题，考虑自身技术条件和资金能力，制定切实可行的目标、指标。