1、育苗床准备
选择培育扦插的地块应深厚肥沃，地势稍高于一般地块，以免扦插育苗时，苗床长时间积水烂根。耕地要在土壤封冻前进行，耕后不耙，经冬季熟冻，等到第2年春再进行耙地，能起到土壤风化和冻死虫卵的效果。因扦插条较长，耕地时深翻40 cm左右。耙地前每亩施复合肥1.2 吨、耙2次后，使地块中的复合肥、硫酸亚铁与土壤混合均匀。作床高35 cm、宽80 cm、长6 m，沟宽40 cm，边沟深45 cm。再在床面上喷0.1%多菌灵溶液1遍以杀菌消毒，能有效防治苗期病害。苗床需在扦插前2 天准备好待插。
2、硬枝扦插
吴茱萸扦插时间一般在3月中旬，选一至二年生的健壮枝条。枝条选取时，一定要选择母株上部，并且要靠近东南、南或南西面的枝条。此类枝条光照充足，聚集的养分相对较多，酶活性高，利于扦插生根成活。剪取枝条建议在清晨或傍晚，无雨后的阴天也可以，下雨或雨后2 天内不要进行采取。首先在母株上剪取20 cm左右的小段，且每段上有芽2～3个。其次将枝条小段上端剪平，下端修剪成斜面，插条两端约离芽各1.5 cm。最后放入干净的保鲜袋中，并在保鲜袋中放2个湿棉球，再封住袋口。运输途中要遮住阳光，防止袋中温度过高损坏插条。
采回的插条要尽快扦插到育苗床中，为了提高插条成活率，将插条下端约1.5 cm处蘸200倍益富源催芽生根剂稀释液，随蘸随扦插。扦插时注意插条不要插倒。按行距25 cm、株距12 cm斜插，插条入土深度为插条长的1/2～2/3，注意插后一定要把四周土压紧，浇1遍透水。
3、扦插地管理
及时搭建荫棚，荫棚透光度在30%左右较好。晴天每天喷水4次，每次30 min左右，保证喷出的水细小，且不留死角。阴天或雨天禁止喷水。雨季来临前要尽早做好清理排水沟的准备，扦插地雨水多时及时排除床内积水，以防插条霉烂，连续多天无雨也不要进行灌溉。
吴茱萸插后一般45 天左右开始生根，此时应将喷水次数减少到每天3次。4月下旬扦插地上部芽抽生新枝，要经常保持新枝叶面有水膜，防止叶过干而凋萎。5月上旬地下害虫也开始活跃，如果不加以防治，害虫往往会危害地下部分插条的外皮和新出的嫩根系。6月上旬扦插苗长至15 cm左右时，为了满足扦插苗木生长发育旺盛时期对养分的需求，可以适当对苗木进行追肥。先将行间浅耙2～3 cm，再条施尿素45 kg每亩，以后每隔15 天施1次，至8月底停止施肥和喷水，促进苗木木质化，有利于冬季抗寒。
4、苗木移栽
吴茱萸扦插经过近8个月的育苗，成活率为70%～80%，当年11月平均苗高达70 cm，地径1.0 cm以上，产苗量为18.0万～22.5万株每亩。当年11月中旬至12上旬即可进行移栽，春栽时间为第2年2月中旬至3月中旬。移栽定植前，按株距3 m、行距4 m，挖穴规格为50 cm×50 cm×50 cm，每穴底部施腐熟农家肥（益富源粪便腐熟剂）6 kg、人粪尿15 kg，与底土拌匀后再栽。每穴栽1棵苗，栽时当土填到穴深1/2时，要将移栽苗轻轻向上提高，使栽植的苗木根系舒展，踩紧穴内填土，再继续填土后踏实，浇足定根水，当水下渗后，补填一些松土。有条件的可以在苗木周围，盖一层10 cm左右厚的稻草保湿。