2009年6月1日开始施行的食品安全法，我国将于6月1日起正
式启用食品流通许可证，取代已沿用了几十年的食品卫生许可证。卫生部、农业部、质检总局、工商总局、食品药品监管局5部门在食品安全的监管上，以分段管理为主，品种管理为辅，新法对食品安全的监管更为严格，今后不再发放食品卫生许可证，而改由各监管部门分段发放生产、流通许可证和餐饮许可。
一、深圳办理食品经营许可证流程
1、申请现场验收流程如下：申请人提出现场验收
2、工商部门到现场核查
3、根据现场核查情况出具现场验收核查意见
4、通过现场核查之后，可申请办理食品经营许可证，程序如下：
（1）提交材料；
（2）工行部门受理；
（3）-审批材料；
（4）发放食品经营许可证。
注意事项：被吊销经营许可证的食品经营者5年内不得申请食品经营许可。报假材料或隐瞒实情而获得食品经营许可的，申请人在一年内不能再次申请。
二、深圳办理食品经营许可证所需材料
1、食品经营许可申请书；
2、经营场所使用证明；
3、食品安全管理制度文本；
4、经营设备、工具清单；
5、食品安全管理人员的身份证明。