申请软件著作权是企业或者个人对于自己作品保护的一种方式。申请软件著作权的意义在于：
作为法律重点保护的依据
鼓励软件著作权登记，并依据国家法律对已经登记的软件予以重点保护。受到侵权时，对于软件著作权登记证书司法机关可不必经过审查，直接作为有力证据使用；此外也是国家著作权管理机关惩处侵犯软件版权行为的执法依据。
作为技术出资入股
《关于以高新技术成果出资入股若干问题的规定》规定：“计算机软件可以作为高新技术出资入股，而且作价的比例可以突破公司法20%的限制达到35%”。甚至有的地方规定：“可以100%的软件技术作为出资入股”，但是都要求首先必须取得软件著作权登记。