有机蔬菜生产中，杂草防治是一项既有难度又费人工的工作。综合国内外的资料，目前主要有以下几种措施：
• 人工除草
种植茄子、瓜、豆类以及芹菜、花菜、甘蓝等蔬菜，育苗床上的杂草可用人工拔除。对多年生草本宿根杂草，必须用人工将这类杂草的根、根茎、球茎挖起、拾净。一般的大田蔬菜在封行前进行人工中耕除草。人工除草虽然费工较多，但除草干净，灵活机动且没有污染，任然是国内外有机蔬菜生产中运用蕞普遍的。
• 覆盖除草
1. 塑料薄膜覆盖
在定植前，将农膜覆盖畦面，也可把畦、沟全部覆盖。然后在农膜上按株行距打顶质控，定植蔬菜。
1. 农家灰杂肥覆盖
2. 在蔬菜生长期，用农家灰杂肥覆盖在植株周围，如番茄栽培时把农家灰杂肥覆盖在根周围，即可防止杂草丛生，又能不断提供番茄生长所需的养分，还有护根、保根的作用。
3. 有机材料覆盖
有机材料覆盖防除杂草，可用树叶、稻草、稻壳、花生壳、棉籽壳、木屑、蔗渣、酒糟等覆盖地面，均有防治杂草的效果。而且又可以为土壤增加有机质，在有机蔬菜栽培种应用较广。
• 机械除草
有条件的地方，在蔬菜作物的生长期间，行间的杂草可用中耕除草机清除，每隔7-10天中耕除草一次。当作物封行后，停止机械除草，可采用人工除草。