1、影响香港公司其他业务事项的办理。例如：转股转董会被要求提供审计报告。
2、银行账户被冻结。随着香港本地银行对已有的本地银行账户监管越来越严格，银行会定期发出调查信函，要求香港公司递交年度审计报告，如未能及时递交，那么银行账户有可能被冻结。
3、信誉降低。多年累积的客户信任度，可能会因为您的企业没有正常进行审计申报税务，而被客人知道后导致信誉扫地；
4、罚款与处罚。香港公司未及时进行税务申报就会产生罚款，如一直不处理，最后的处罚将会是被告上法庭或限制出入香港。
其实都是香港政府及香港本地银行，对注册的香港公司业务情况存疑。而要向香港政府及香港本地银行证明，香港公司业务的合法性，比较好的证据就是香港执业会计师出具的香港公司审计报告（审计报告必须由第三方香港执业持牌会计师，对该香港公司账目进行“核数”，因此具有很高的公信力）。