生物质燃烧机使用期间都会定期排除灰渣，才能确保其安全运行，不过这里的灰渣排污工作也是有讲究的，如果不注意的话不仅无法彻底有效的排污，甚至还有可能会对生物质燃烧机造成负面影响。
在开始生物质燃烧机的排污工作之前，先要将其水位调至稍微高于正常水位线状态，且排污管内不应该有流动的声音；可以用手触摸排污阀以外的排污管道，如果感到温度较高，则说明排污阀有泄漏情况，应及时检查，查明原因后在进行消除。
而且生物排污工作就需要经常性、均匀性的进行，可以同时有多根排污管，必须对每一根排污管轮流进行排污工作。如果只对其中一部分的排污管进行排污，而另一部分不进行排污的话，会因堵塞而导致水循环破坏。
生物质燃烧机在进行排污工作时，要求在压火之后进行或者负荷低时进行，因为此时设备中的水循环相对比较缓慢，管道内的污垢也容易堆积，从而得到排污效果将会更好，同时还不会对生物质燃烧机造成影响。
另外，生物质燃烧机内的排污操作应在短促状态下进行，也就是每次排污时间间隔短，多次重复，这样有利于污垢迅速向排污口进行回合，从而可以集中性的排出。