港珠澳大桥的主体工程基本都归属于珠海市管辖，根据从前通行方针，只有持港珠澳大桥口岸“粤港”、“港澳”两地车牌等跨境车辆才能经大桥过境。珠海市公安部门相关负责人表示，大桥开通两个多月来，极大地方便了粤港澳三地市民往返粤港澳三地。
而对于其它没有办理港珠澳两地车牌的港澳单牌车辆因故需要经大桥进入内地的，根据内地交通安全法律法规，以往需要提前申请临时跨境机动车牌证；但这一过程需要申办者跨境往返办理，手续繁琐、耗时较长，不利于港澳车辆经港珠澳大桥便利往来，很难充分发挥大桥的便利性。
港珠澳车牌申请条件：
第一类是香港通过大桥进入内地并获得内地牌照的指标：对于在我省投资的海外投资企业（个人），无论投资额多少，由我们支付的税款总额 3年（含投标年份）的省级企业已达到10个。对于人民币1万元以上的，可以申请通过港珠澳大桥港口的商用车指标; 如果他们支付超过人民币50万元，他们可以申请第二辆车; 对于第一个，他们可以申请第三辆车。
第二类是大陆通过桥梁进入香港并收到香港车牌：省内批准的国有企业，集体企业和私营企业，三年内征税超过100万元 （包括投标年份）。