缺点:
1，电池续航能力有限。续航能力较强的型号在经济航速下也只能达到2-3小时的续航能力，虽然个人休闲娱乐不是问题，但商业运营就必须通过增加电池组来满足续航要求。
2，功率范围较小。目前马力的量产电动舷外机是德国Torqeedo公司的80马力，和汽油舷外机雅马哈、水星等动辄300、350马力相比还是太小，限制了它在大型船只的推广应用。
3，首次购置成本较高。作为舷外机行业的高端产品，给用户提供优秀的使用体验的同时，因为成本的原因，价格也较高。
需要指出的是，常见的众多的拖弋马达(Trolling Motor)，包括进口的国产的，并不是严格意义上的"船外机"。他们的功率较小，扭矩更小，推进效率低，只能作为辅助动力调整船的位置、方向，而无法作为推进动力快速、持续航行。