实验室废水处理本着分类、收集、就地、及时的原位处理，简易操作，以废治废和降低成本的原则。实验室废水的处理不能等同于工业污水处理，而是采用多单元处理流程系统或是有针对性的进行分类处理，尽可能地降低处理难度，使处理费用降低，操作比较简单。
部分废水处理方法：
酸、碱废液 ：酸、碱废液在化学实验室内常见。一般的清洗玻璃器皿的废液，因经大量水洗涮，浓度极小，故可直接排放。浓度较高的酸碱废液，平时分开贮存，定期混合再中处理，做到以废治废，使其pH值在6. 5～8. 5之间，达到排放标准。
汞及含汞废液：如，打碎温度计，或极谱分析操作失误等，必须及时清除散装的汞，用滴管、棉花或用在硝酸汞的酸性溶液中浸过的薄铜片、粗铜丝收集于烧杯中，用水覆盖。散落于地面难以收集的微小汞珠，应尽快撒上硫磺粉，使其化合成毒性较小的硫化汞后清除干净；或喷上20%三氯化铁的水溶液，干后再清除干净。含汞溶液包括有机汞和无机汞，有机汞的废液中加入适当的氧化剂分解为无机汞，机汞的废液调节pH为8-10，因硫化汞溶度积很小，为4×10-53。因此，常用H2S、Na2S、NaHS、(NH4)S作为剂来沉淀汞，Hg+、Hg2+离子转化为难溶的Hg2S和HgS沉淀，由于汞有剧毒，滤液用活性碳处理后再过滤排放。
含铬废液的处理：含铬废液主要来源是氧化废水、电镀废水、铬酸洗液及制备有机化合物等，一般这种废液中含有铬(Ⅲ)和铬(Ⅵ)两种价态的重金属，毒性较大。可以向含铬废液中加入还原剂，如硫酸亚铁、亚硫酸氢钠、二氧化硫、水合肼或者废铁屑，在酸性条件下将Cr(Ⅵ)还原为Cr(Ⅲ)，然后加碱如NaOH、Ca(OH)2、Na2CO3等。调节pH值，使Cr(Ⅲ)形成低毒的Cr(OH)3沉淀，清液可排放，沉淀经脱水干燥后或综合利用，或用焙烧法处理，使其与煤渣或煤粉一起焙烧，处理后的铬渣可填埋。
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