1、土壤酸化
正常土壤pH值大概在7左右，而我们使用化肥大部分是酸性的，尤其是一些小厂家生产的化肥质量不过关，酸性程度更严重。土壤过酸或过碱作物都无法健康生长。本来化肥就是一个强酸弱碱盐，长期大量使用，会造成土壤酸化，ph值降低。
2、土壤盐渍化
化肥本身就是一个无机盐，由盐离子构成，过多的离子残存到土壤之后，导致土壤含盐量过高。表现在：根系不能正常吸水，影响蔬菜植株生长，严重的时候可以说作物就像种在盐水里，出现淹根、死棵。盐离子之间会产生拮抗，影响蔬菜对各种元素的吸收利用。
3、土壤生物性状的恶化
土壤中富含微生物，各种微生物之间互相作用、互相影响。健康的土壤生物性状是比较好的，有害菌群和有益菌群处于一个平衡的状态。当我们不断种植，不断加入化学肥料，土壤中微生物菌群开始慢慢失调，即有害菌的数量越积累越多，有益菌的数量越来越少。
4、土壤板结
土壤板结简单来说就是土壤变硬，根系扎不下去了。根系坏死，根系越来越浅，影响作物吸收水肥能力。