消毒的主要目的是消灭传染源的病原体。疫病发生要有三个基本环节:传染源、传播途径、易感动物。在畜禽养殖中，有时没有看到疫病发生，但外界环境存在传染源，传染源会释放病原体。如果没有严密的消毒措施，病原体就会通过空气、饲料、饮水等途径，入侵易感畜禽，引起疫病发生。如果没有及时消毒，净化环境，环境中的病原体就会越积越多，达到一定程度时，就会引起疫病流行。因此，消毒应注意三个环节:栏舍(即带畜禽)消毒、舍外环境消毒(包括用具、车辆等)和饮水消毒。带畜禽消毒每周应不少于3次，环境消毒每周1次，饮水始终要消毒或保证清洁。