大菱鲆自引进我国以来发展迅速，已经在山东、河北、辽宁等环渤海地区形成大规模的养殖。伴随着养殖规模的扩大、养殖密度的增加和品种的退化，大菱鲆的病害日趋增多，制约养殖的发展。近几年来纤毛虫病成为危害大菱鲆的主要寄生虫病，被广泛认为是工厂化养殖鱼类中重要的疾病之一。
大菱鲆纤毛虫一年四季都可发生，以春、夏两个季节为发病高发期。大菱鲆的苗期、养成期、亲鱼培育期均有可能发生感染，以幼鱼的发病率高。主要是寄生在皮肤、鳃、脑和胃等。
患病的鱼摄食量减少，活力低下，抢食能力低，常不安的狂游、打转、上浮、游动失衡，蹭池边，病鱼张大口，鳃盖张开，反应迟钝，浮于水面或者是沉于水底，不久后就会死亡。
大菱鲆的体表粘液对于将病原菌微生物具有一定的灭杀作用，粘液增多，抗病能力越强，感染的机会越小。而从感染纤毛虫的情况来看，都是由于各种原因，导致鱼体受伤出现伤口，纤毛虫从伤口中进入从而感染。在养殖中一般有以下几种情况可以造成纤毛虫的感染。
1、鱼苗种质退化或者是不健康。新买的鱼苗如果体质较弱或者是不健康，加上换到新的水环境等原因，容易诱发纤毛虫病。
2、苗种运输。特别是异地购苗，经过长时间运输，鱼体之间相互摩擦造成体表损伤，给纤毛虫感染创造了条件；再一个就是运输中发生应激反应，鱼体排放大量粘液，失去保护层，增加了感染的几率。
3、水质恶化、饲料不卫生。养殖过程中，深水井的水质恶化，污染物进入等原因，导致养殖环境恶化，容易导致纤毛虫的发生；另外在饲料的使用中，变质的饲料或者是饲料添加剂的添加不当也容易导致纤毛虫的发生。
4、滥用抗生素和消毒剂是诱发纤毛虫的主要原因。有的养殖户缺乏基本的药理知识，对消毒剂和抗生素的作用机理弄不清楚，这种情况下很容易引发纤毛虫。例如，甲醛可以杀死纤毛虫也可以诱发纤毛虫。主要原因就是甲醛在使用过程中可破坏鳃丝更容易引发纤毛虫寄生在腐烂的鳃丝上。
对于已经寄生到鱼体内部的纤毛虫病例，目前尚无有效的治疗解决方案，所以对于这种顽疾我们能做的还是预防，预防要从以下几点入手：
1、保持良好的养殖水环境，如水温、透明度、水体溶解氧、氨氮、重金属等指标的正常，有条件的养殖场定期做一下检测。
2、定期清扫池底和消毒。及时清理养殖池底污物，投饵后马上大排水，保持池底清洁卫生。
3、投喂新鲜、不变质的饲料。可以在饲料中添加胆汁酸，保护肝脏健康，增强自身免疫力，增强抗病能力。
4、使用安全药物防控。平时拌料服用乐畅桉树精油可以有效防止纤毛虫感染。乐畅桉树精油，提取于澳大利亚特有生产的多苞桉叶子中，富含丰富的1，8桉叶素、单萜烯、倍半萜烯等天然成分，天然具有抗虫抑虫的效果，可以抑制寄生虫的繁殖，防止寄生虫感染。安全无毒，可长期添加。
大菱鲆纤毛虫治疗效果差，治愈比较困难其周期长，所以在养殖中要做好防范的措施，减少纤毛虫的感染几率，降低发病率。