鲜奶巴氏杀菌机采用的是巴氏杀菌法，是来源于德国的一种杀菌方法。它是将鲜奶以低温加热半小时的方法来有效清除鲜奶内的有害菌。
鲜奶巴氏杀菌机有冰制冷型、压缩机制冷型、单罐型以及经济型。经济型是以自来水循环来加热杀菌，对水源比较浪费，但是价格比较实惠。
压缩机制冷型巴氏杀菌机有两个水箱，分别为热水箱跟冷水箱，侧面有表示水位的液压计，还有连接制冷压缩机的接口，接口处有制冷管。箱体上半部分有用来调控的电控箱。
奶罐可以定做，大多数是100或150型，上面有搅拌电机跟温度计，内部有用来搅拌鲜奶的搅拌尺，作用是使鲜奶不会糊底。罐体底部还有一个水龙头接口，用来取杀菌完成的鲜奶。奶罐分三层，里面是盛奶层，中间杀菌层，外面保温层。
杀菌方法普遍分为两种，一种是高温杀菌121℃，一种是低温杀菌（也就是巴氏杀菌），在85℃。如果牛奶加热到超过100℃，牛奶就会产生乳糖胶，会流失一大部分养分。所以牛奶杀菌一般会采用低温巴氏杀菌法来清除牛奶内的有害菌和芽孢，只需低温85℃加热半小时即可完成。高温杀菌比较适合肉制品，不适合乳制品。