《新京报》标准字为天安门城墙色底方正大标宋加粗反白。《新京报》符号总是跟天安门城墙颜色出现在一起，时刻提醒国内外读者《新京报》有浓厚的北京特色和中国特色；方正大标宋，表达与国际接轨和借助科技进步的愿望；加粗反白，突出镂刻效果，强调视觉冲击力，象征《新京报》要成为一块传世招牌。
《新京报》在有关政策允许的范围内，设置企业化的经营架构，把广告和发行纳入公司化运作，使其与采编内容截然分离，保持报纸的独立性和公信力。正是基于报纸的影响力和公信力，基于对报业经营市场化的深刻领会和不懈实践，《新京报》的品牌价值和经营业绩不断提升，连续两年被有关权威机构评为“中国投资价值的媒体”、“中国有成长潜力的媒体”、“中国新锐报纸”、“中国有影响力的时政类报纸”等。2006年《新京报》广告刊例达到6.12亿元。