日本商标注册申请流程：
1、申请人在申请日本商标注册前需要进行拟注册商标查询，将拟注册商标提交至日本专利商标局进行查询;
2、申请人将拟注册商标提交日本专利商标局后，日本专利商标局将对符合规定的商标进行受理，并将电子受理回执文件送达申请人，电子回执文档中包括拟注册商标的申请信息、申请日期、申请号等;
3、拟定注册商标被日本专利商标局受理后，将进入审查环节，而日本商标注册的审查环节需要经历形式审查和实质审查，其中形式审查主要是审查日本商标注册申请文件是否符合要求;实质审查主要是审查拟注册商标是否具有可注册性、显著性等。
4、拟注册日本商标在通过审查后，将进入公告期后，日本商标的公告期与其他国家有所不同，仅60天，此期间任何第三方均可对该公告的商标提出商标异议。
5、拟注册日本商标在异议期内没有异议或异议不成立的，将核准其日本商标注册，此期间若有审查意见则时间会相对延长，待审查意见结束后将会下发商标证书。
整个流程下来如果选择明途知产办理大概需要六至八个月的时间就可以完成。