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目前，规模化养殖场的病原微生物多重感染或继发感染十分普遍，既有病毒的混合感染，也有细菌的混合感染，还有病毒和细菌的混合感染，以及存在一些原发性感染情况下出现继发感染。
据调查，规模化养殖场存在着口蹄疫病毒、伪狂犬病毒、肺炎支原体、链球菌、胸膜肺炎放线杆菌、巴氏杆菌、附红细胞体、大肠杆菌等病原微生物的威胁。
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选择消毒液时，要对消毒对象、目的、疫病种类，调换不同类型的药物。如有些病毒（结构中无胞浆膜病毒）对普通消毒药不敏感，特别是圆环病毒，一般消毒药对它不起作用，应选择高效消毒药。对带畜消毒，刺激性大，腐蚀性强的消毒药不能使用，如氢氧化钠等，以免造成人畜皮肤等处伤害；对注射部位消毒可选择中效消毒药等。
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