肠道是营养消化吸收的场所。肉鸡肠道健康要综合考虑营养、疾病及饲养过程中的各个环节，比如种鸡、孵化场及肉鸡舍的管理。只有肉鸡肠道健康的情况下，才可能实现肉鸡的健康，最终实现鸡肉食品安全，才不会有沙门氏菌、空肠弯曲杆菌等食源性细菌的污染。
目前临床上很多肉鸡的腿病也与肠道健康也是息息相关，肠道病原菌穿过肠道屏障，通过血液循环，移位至骨骼关节部位，引起关节软骨的炎症，导致软骨的坏死，从而形成肉鸡腿病。
肉鸡健康=肠道健康
多种因素与肉鸡肠道健康有关，包括雏鸡质量、产气荚膜梭菌、球虫、呼吸道疾病、肌胃疾病、包涵体肝炎、细菌性软骨坏死伴发骨髓炎等其他未知因素。雏鸡的质量与坏死性肠炎发生率成正相关。可通过降低雏鸡的饲养密度，提供更大的雏鸡活动面积，减少雏鸡坏死性肠炎的发生率。同时采用病毒疫苗免疫接种时，要关注疫苗的剂量和合理的免疫程序，来保护肉鸡健康。农场管理也与坏死性肠炎密切相关，管理差的农场，坏死性肠炎的发生率会高很多；合理的空舍期也能减少坏死性肠炎的发生，建议空舍期最短14天以上。